Tiedeuutiset

MRSA-bakteerin liikkeitä maailmassa kartoitettiin dna:sta

: Tiedeuutiset

21.01.2010, klo 22.00

Lukuisille antibiooteille vastustuskykyisten MRSA-bakteerien leviämistä ja muuntumista on kartoitettu uudenlaisella tutkimuksella joka perustuu bakteereiden koko genomin kartoitukseen ja vertailuun. Aineistoja oli kaksi: eri puolilta maailmaa 20 vuoden aikana kerätyt näytteet sekä pohjoisthaimaalaisen sairaalan MRSA-bakteerit. Perimän vertailu osoitti mm. että lontoolaissairaalan teho-osaston MRSA-epidemia sai todennäköisesti alkunsa Thaimaasta tulleesta bakteerista.

MRSA-bakteerit eli "sairaalabakteerit " ovat Staphylococcus aureus-bakteereita, jotka ovat muuntuneet sietämään yleisimpiä antibiootteja. Kaikki stafylokokit aiheuttavat tulehduksia, jotka normaalisti ovat hoidettavissa antibiooteilla. Ne voivat aiheuttaa myös keuhkokuumeen tai muun hengenvaarallisen sairauden, jotka ovat ongelma erityisesti niille joiden vastustuskyky on muutenkin huono eli vanhoille ja kroonisesti sairaille ihmisille. Näitä bakteereita elää ihmisen ihon pinnalla ja limakalvoilla yleisesti mutta ne eivät aiheuta sairautta kuin poikkeustapauksissa.

MRSA-bakteereita ilmaantui antibioottien käytön yleistyttyä eli 1960-luvulla. Sittemmin niistä on tullut hankalasti hoidettava ongelma sairaaloissa kaikkialla maailmassa. Niiden torjumiseksi pitäisi tuntea paremmin bakteerien evoluutio ja leviämistapa. Laajassa kansainvälisessä tutkimuksessa kartoitettiin samaan ST239-bakteerikantaan kuuluvien, 63 bakteerin koko genomi ns. uudella geenien kartoitustekniikalla.

Kolmasosa bakteereista oli yhdestä thaimaalaisesta sairaalasta ja ne oli kerätty seitsemän kuukauden aikana. Loput olivat vuosina 1982-2003 kerättyjä näytteitä Pohjois- ja Etelä-Amerikasta, Euroopasta, Australiasta ja Aasiasta. Kaikki tutkitut bakteerit olivat erilaisia. Bakteereille rakennettiin perimän muutosten perusteella "sukupuu", joka kertoo miten kyseinen bakteerikanta on muuttunut ja liikkunut.

Thaimaalaissairaalasta eristetyissä bakteereissa oli kaksi eri ryhmää, jotka olivat ilmeisesti tulleet sairaalaan eri tietä. Niiden joukossa oli viisi melko samankaltaista bakteeria, jotka olivat tartuttaneet vierekkäisillä teho-osastoilla hoidossa olleet potilaat muutaman viikon sisällä. Sairaalan muilta osastoilta löydetyt MRSA-bakteerit poikkesivat toisistaan paljon enemmän.

Tulosten perusteella pystyttiin arvioimaan tutkitun MRSA-bakteerikannan mutaationopeus: siinä tapahtuu yhden emäsparin muutos kuudessa viikossa.

Resistenttien stafylokokkien maailmanlaajuisen leviämisen selvittämiseksi tarvittiin lisäksi tilastollisia malleja. Eurooppalaiset MRSA-bakteerit ovat kasautuneet sukupuun kantaosaan ja mutaationopeuden perusteella arvioitiin, että analysoitu ST239-MRSA-bakteerikanta on lähtöisin Euroopasta 1960-luvulta. Antibioottien käyttö lisääntyi voimakkaasti 60-luvulla eikä alussa osattu varoa huolettomasta käytöstä syntyvää resistenssiä. Uudet tulokset voivat tutkijoiden mukaan auttaa bakteerien torjunnassa.

(YLE tiede, Science)